AEQUA edita periódicamente publicaciones monográficas de carácter temático, cuya aparición suele coincidir con congresos o reuniones de especial interés. Hasta el momento se han publicado las siguientes:

1989 El Cuaternario en Andalucía Occidental.
Monografías AEQUA número; 1. 
Eds: F. Díaz del Olmo y J. Rodríguez Vidal

1994 Gibraltar during the Quaternary.
Monografías AEQUA número; 2. 
Eds: J. Rodríguez Vidal; F. Díaz del Olmo; C. Finlayson y F. Giles  Pacheco.

1995 Reconstrucción de paleoambientes y cambios climáticos durante el Cuaternario.
(Actas de la IX Reunión sobre Cuaternario). Monografías AEQUA número; 3. 
Eds:.T. Aleixandre y A. Pérez González.

Raña era el boletín informativo de dos Asociaciones (AEQUA y Sociedad Española de Geomorfología).

En él se comunicaban noticias, tesis doctorales, información sobre congresos, publicaciones recientes, actos de interés, etc.

Se dejó de publicar en el año 2001 tras la instalación definitiva de la página web de AEQUA.